Zu den Aufgaben der Herzchirurgie gehören die chirurgische Behandlung der koronaren Herzkrankheit (Bypassoperation), Klappenersatz und Klappenrekonstruktion, die Behandlung angeborener Herzfehler und von Erkrankungen der thorakalen Aorta (Brustschlagader).

Ebenfalls gehören zur Herzchirurgie die chirurgische Therapie von Herzrhythmusstörungen (Schrittmacher, implantierbare Defibrillatoren), Erkrankungen des Herzmuskels mit akuter und chronischer Herzinsuffizienz (Kunstherz, Herztransplantation, Schrittmacher zur Resynchronisationstherapie, extrakorporale Kreislaufunterstützung), Erkrankungen der Lungengefäße, sowie die Lungentransplantation.

Zusätzlich werden in einem eigenen herzchirurgischen Forschungslabor experimentelle Untersuchungen zu herzchirurgischen Fragestellungen und Grundlagenforschung auf dem Gebiet Herz-Kreislauferkrankungen betrieben.